Nasce nel 1982 su iniziativa di un gruppo di giovani che vogliono sperimentare un lavoro piacevole, rispettoso della loro salute e di quella dei consumatori, un lavoro che vada d'accordo anche con la tutela dell'ambiente. Per questo, sin dall'inizio, si occupa di attività produttive ecosostenibili utilizzando il metodo di agricoltura biologica pioneristicamente, ancor prima che venisse disciplinato dalle norme europee e nazionali. Da subito si occupa di orticoltura e frutticoltura allargando il suo campo di interesse alla produzione del miele, dei formaggi del vino dell'olio e delle carni.

La Cooperativa sostiene con convinzione la strada dell'associazionismo promuovendo alla fine degli anni '80 la costituzione delle Associazioni Regionale e Nazionale di agricoltura biologica (ARPA Sardegna ed AIAB) e, successivamente, diverse esperienze consortili di successo: (Consorzio Ecosviluppo Sardegna, MOC Ortofrutta Sardegna, Consorzio BioMediterraneo, Consorzio garanziaAIAB).

Da una decina di soci con due ettari di terra, nei primi anni di vita, di strada ne è stata fatta tanta: oggi la Cooperativa ne conta quasi un centinaio, sparsi in tutta la Sardegna con una superficie di oltre 2000 ettari, tutti coltivati con il metodo biologico. S'Atra Sardigna è la più importante organizzazione di produttori biologici nel Sud d'Italia.